Das Comenius-Museum in Přerov darf sich rühmen, das älteste Museum seiner Art in der Welt zu sein. Das Renaissanceschloss beherbergt Mineraliensammlungen, Rekonstruktionen von Klassenzimmern aus dem 17. Jahrhundert bis in die 1950er Jahre und eine Ausstellung zur Ethnografie der Region Haná.
Im Mittelpunkt der Ausstellungen steht der Lehrer der Nationen J. A. Komenský, der die Brüderschule in Přerov besuchte und später dort unterrichtete; man erinnert darüberhinaus an den hiesigen Landsmann Jan Blahoslav, einen bedeutenden Sprachwissenschaftler und Übersetzer. Sehr wertvoll ist die Sammlung der in der Region Přerov zu Tage geförderten archäologischen Funde. In einem an das Museum angeschlossene Institut betreibt man auch Forschungen auf dem Gebiet der Geschichte des Schulwesens, der Komeniologie und der Regionalgeschichte. Weiterhin finden in dem Museum auch eine ornitologische Station, die Verwaltung der Burg Helfštýn und die Schlossverwaltung ihren Platz.