W Twierdzy Wodnej znajdują się ekspozycje poświęcone lokalnej przyrodzie, a zwłaszcza historii Jeseników. Nie można przegapić ekspozycji poświęconej niesławnym procesom czarownic.
Muzeum miejskie w Jeseniku (dawniej Frývaldov) zostało założone jesienią 1900 roku, w okresie dużego zainteresowania społeczeństwa lokalną historią i słowiańskimi korzeniami. Okoliczni mieszkańcy zasilili zbiory muzeum, a pierwszym obiektem kolekcji był żelazny krzyż z rokiem 1646, związany z legendą o jesenickim kacie.
Wystawy zainaugurowano w grudniu 1905 roku. Po kilku latach powiększanie zbiorów spowodowało konieczność przeniesienia muzeum, a dzięki porozumieniu z przedstawicielami biskupstwa wrocławskiego, do którego należał wówczas Jesenik, udało się pozyskać na te cele pomieszczenia Twierdzy Wodnej. Na początku lat trzydziestych XX wieku muzeum mogło zostać ponownie otwarte w nowym budynku, jednak II wojna światowa znacząco zakłóciła jego działalność. W 1945 roku reszta kolekcji, która została zebrana po kilku przeprowadzkach, powróciła do twierdzy, a muzeum stopniowo wznowiło swoją działalność. Od 2007 roku trwa jego długotrwała rekonstrukcja.
Obecnie oferuje stałe ekspozycje poświęcone historii i archeologii regionu Jesioników, faunie i florze regionu Jesioników, a w piwnicy bardziej wytrwali zwiedzający mogą na nowo zapoznać się z historią procesów czarownic w Jesionikach. W muzeum w dwóch salach wystawowych regularnie odbywają się wystawy krótkoterminowe. Do muzeum nalezy również dom Vincenca Priessnitza, założyciela uzdrowiska Jeseník.