Roku 1876 maturoval na německém gymnáziu v Olomouci a poté studoval matematiku, fyziku a filozofii v Lipsku, Berlíně a ve Vídni. Publikoval několik svých prací a roku 1918 založil Freiburskou fenomenologickou společnost. Jeho první asistentkou byla pozdější řeholnice Edith Steinová a roku 1919 ji vystřídal Martin Heidegger, který se později stal Husserlovým nástupcem.

Husserl podnikl řadu přednáškových cest po Německu i do ciziny a napsal své poslední velké dílo "Krize evropských věd", věnované otázce "přirozeného světa" a krizi smyslu. Roku 1933 byl však nacisty vypuzen. Přes 40 tisíc stránek jeho textů a poznámek dopravil ještě roku 1937 do bezpečí v belgické Lovani odvážný františkán Herman Leo van Breda.